Η χολή που σκληραίνει στη χοληδόχο κύστη μπορεί να προκαλέσει πέτρες στη χολή. Οι χολόλιθοι μπορούν να εμποδίσουν την έξοδο της χολής από τη χοληδόχο κύστη, γεγονός που προκαλεί έντονο πόνο. Τα άτομα με νόσο του Crohn στον τελικό ειλεό διατρέχουν αυξημένο κίνδυνο να αναπτύξουν χολόλιθους. Έως και 13% έως 34% θα παρουσιάσουν αυτήν την επιπλοκή. Η φλεγμονή στον ειλεό εμποδίζει την απορρόφηση της χολής. Η χολή διαλύει τη χοληστερόλη από τα τρόφιμα και εάν αυτή η χοληστερόλη δεν διασπαστεί, μπορεί να οδηγήσει σε πέτρες στη χολή. Οι χολόλιθοι συνήθως αντιμετωπίζονται με χειρουργική αφαίρεση της χοληδόχου κύστης. Η θεραπεία με φάρμακα χρησιμοποιείται λιγότερο συχνά, επειδή οι πέτρες στη χολή μπορεί να υποτροπιάσουν.
Στοματικά έλκη
Τα μικρά, ρηχά έλκη που εμφανίζονται στο εσωτερικό του στόματος ονομάζονται αφθώδης στοματίτιδα. Μπορούν να χρησιμοποιηθούν συνταγογραφούμενα στοματικά διαλύματα για να διατηρηθεί το στόμα καθαρό, αλλά συνήθως δεν απαιτείται άλλη θεραπεία. Οι ήπιες περιπτώσεις μπορεί να επουλωθούν από μόνες τους, αλλά τα τοπικά αντιφλεγμονώδη και τα αναισθητικά μπορεί να μειώσουν την ενόχληση και να προάγουν την επούλωση.

Καταστάσεις του δέρματος
Τα άτομα με νόσο του Crohn στο παχύ έντερο μπορεί να αναπτύξουν δερματικές ετικέτες. Το δέρμα γύρω από τις αιμορροΐδες στην περιπρωκτική περιοχή παχαίνει και δημιουργεί πτερύγια. Πρέπει να λαμβάνεται μέριμνα ώστε να διατηρείται η περιοχή του πρωκτού καθαρή, γιατί οι δερματικές ετικέτες μπορεί να διατηρήσουν τα κόπρανα και να οδηγήσουν σε ερεθισμό του δέρματος. Η παρουσία δερματικών ετικετών μπορεί να είναι χρήσιμη για τη διάγνωση της νόσου του Crohn επειδή είναι περισσότερο συχνή σε άτομα με νόσο του Crohn παρά με ελκώδη κολίτιδα.
Άλλες δερματικές παθήσεις που σχετίζονται με τη νόσο του Crohn είναι το οζώδες ερύθημα και το γάγγραινο πυόδερμα. Το οζώδες ερύθημα είναι επώδυνοι ερυθροί όζοι που αναπτύσσονται στα χέρια ή τα κάτω πόδια και η γαγγραινώδης πυόδερμα είναι μια φλύκταινα στα πόδια ή τα χέρια που συνήθως σχηματίζεται στη θέση ενός μικρού τραύματος, όπως ένα κόψιμο. Και οι δύο αυτές καταστάσεις είναι λιγότερο συχνές στη νόσο του Crohn παρά στην ελκώδη κολίτιδα. Το οζώδες ερύθημα μπορεί να επηρεάσει το 1% έως 2% των ατόμων με νόσο του Crohn του παχέος εντέρου και το γάγγραινο πυόδερμα μπορεί να επηρεάσει το 1% των ατόμων με νόσο του Crohn.