Ορισμένες επιπλοκές της νόσου του Crohn δεν σχετίζονται άμεσα με τη φλεγμονή στο λεπτό ή παχύ έντερο και ονομάζονται «συστημικές» ή «εξωεντερικές» παρενέργειες. Αυτές οι επιπλοκές μπορεί να περιλαμβάνουν αρθρίτιδα, απώλεια οστού, καθυστερημένη ανάπτυξη στα παιδιά, οφθαλμικές παθήσεις, πέτρες στη χολή, δερματικά εξανθήματα ή βλάβες και στοματικά έλκη.
Δεν είναι γνωστό γιατί οι επιπλοκές της νόσου του Crohn μπορούν να εμφανιστούν εκτός του πεπτικού σωλήνα, αλλά σε ορισμένες περιπτώσεις, ακολουθούν την πορεία της νόσου: επιδεινώνονται κατά τη διάρκεια μιας έξαρσης και βελτιώνονται κατά τη διάρκεια της ύφεσης.
Αρθρίτιδα
Ο πόνος, το πρήξιμο και η δυσκαμψία στις αρθρώσεις ατόμων που πάσχουν από νόσο του Crohn μπορεί να οφείλονται σε περιφερική αρθρίτιδα. Τα συμπτώματα μπορεί να διαρκέσουν μέρες ή εβδομάδες και μπορεί να μεταναστεύσουν από τη μια άρθρωση στην άλλη. Η περιφερική αρθρίτιδα μπορεί να βελτιωθεί όταν η υποκείμενη νόσος του Crohn αντιμετωπιστεί επιτυχώς και δεν προκαλεί μόνιμη βλάβη στις αρθρώσεις. Τα συμπτώματα αντιμετωπίζονται με υγρή ζέστη και ξεκούραση. Τα άτομα με νόσο του Crohn μπορεί επίσης να αναπτύξουν άλλες μορφές αρθρίτιδας, είτε ως επιπλοκή είτε ως ανεπιθύμητη ενέργεια του φαρμάκου.

Οστική απώλεια
Τα άτομα που ζουν με τη νόσο του Crohn διατρέχουν κίνδυνο απώλειας οστικής μάζας και οστεοπόρωσης για διάφορους λόγους. Το ασβέστιο είναι σημαντικό για την υγεία των οστών και η βιταμίνη D είναι απαραίτητη για να απορροφήσει το σώμα το ασβέστιο. Ωστόσο, τα άτομα με νόσο του Crohn μπορεί να έχουν έλλειψη βιταμίνης D, ειδικά εάν το λεπτό έντερο έχει εκτεταμένη ασθένεια ή έχει αφαιρεθεί εν μέρει μέσω χειρουργικής επέμβασης.
Επιπλέον, πρωτεΐνες που ονομάζονται κυτοκίνες έχουν βρεθεί σε υψηλότερα επίπεδα σε άτομα με νόσο του Crohn, ειδικά όταν η νόσος είναι ενεργή. Οι κυτοκίνες μπορεί να παρεμβαίνουν στην αφαίρεση του παλιού οστού και στη δημιουργία νέου οστού. Άλλοι παράγοντες κινδύνου για απώλεια οστικής μάζας περιλαμβάνουν το χαμηλό σωματικό βάρος, το γυναικείο φύλο κατά τη γέννηση, το κάπνισμα, τη χρήση αλκοόλ και τη μεγαλύτερη ηλικία.
Οι γενικές συστάσεις για την πρόληψη της οστικής απώλειας περιλαμβάνουν την άσκηση, τη μείωση της χρήσης αλκοόλ, τη διακοπή του καπνίσματος και τη λήψη συμπληρωμάτων με 1500 mg ασβεστίου και 400 IU βιταμίνης D ημερησίως. Για τα άτομα με φλεγμονώδη νόσο του εντέρου (IBD), η μείωση της χρήσης κορτικοστεροειδών όταν είναι δυνατόν και η λήψη ενός φαρμάκου διφωσφονικού είναι επίσης χρήσιμες.