Όπως και με κάθε τύπο εμβολιασμού, πριν λάβουν έγκριση τα εμβόλια για τον καρκίνο του τραχήλου της μήτρας(εμβολιασμός HPV) έχουν εξεταστεί εκτενώς σε κλινικές μελέτες που περιλαμβάνουν χιλιάδες γυναίκες από ένα ευρύ ηλικιακό φάσμα.
Τα αποτελέσματα ελέγχονται κατά τη διάρκεια κάποιων ετών και αναλύονται για πιθανές ανεπιθύμητες ενέργειες. Ο εμβολιασμός έναντι του καρκίνου του τραχήλου της μήτρας είναι γενικά καλά ανεκτός. Όπως και με άλλα εμβόλια έχουν αναφερθεί ανεπιθύμητες ενέργειες, οι συχνότερες από τις οποίες ήταν κοκκινίλα, πρήξιμο και ήπιος πόνος στο σημείο της ένεσης και οι οποίες, στις περισσότερες περιπτώσεις, δεν είχαν μεγάλη διάρκεια.
Στη συνέχεια οι ιατρικές και κρατικές αρχές της κάθε χώρας μελετούν όλα τα στοιχεία πριν δώσουν την έγκριση για άδεια κυκλοφορίας στη συγκεκριμένη χώρα. Μόνο τότε, μετά από χρόνια έρευνας και ελέγχου, ένα εμβόλιο ή φάρμακο μπορεί να θεωρηθεί κατάλληλο για συνταγογράφηση.
